Η ακρόπολη της Μάλθης περιβάλλεται από οχυρωματικό περίβολο με συνολικό ανάπτυγμα που φτάνει τα 410 μέτρα, με τις νεότερες έρευνες να καταδεικνύουν πως η οχύρωση του οικισμού κατασκευάστηκε στην Πρώιμη Μυκηναϊκή εποχή. Η βόρεια πλευρά σώζεται σε μεγαλύτερο πάχος και εκεί ανοίγεται μια από τις κύριες πύλες του οικισμού. Η δυτική πλευρά του τείχους έχει γερή θεμελίωση καθώς βρίσκεται πάνω στον φυσικό βράχο, ωστόσο το τείχος έχει υποχωρήσει σε αρκετά σημεία και έχει καταστραφεί. Η ανατολική πλευρά φαίνεται πως είχε κατάλληλη αμυντική διαμόρφωση στην αρχαιότητα τεκμηριώνοντας πιθανότατα πως οι εχθρικές επιθέσεις γίνονταν από εκεί.

Την περίοδο πριν την οχύρωση ο οικισμός ήταν διασκορπισμένος και ανοχύρωτος και οι οικίες είχαν καμπυλόγραμμες κατόψεις, ενώ αντίθετα, στην εποχή μετά την κατασκευή της οι οικίες παρατηρούνται να αποκτούν κατόψεις με ευθύγραμμες πλευρές και πολλά κτήρια κατασκευάζονται στην εσωτερική πλευρά του οχυρωματικού περιβόλου, χρησιμοποιώντας τον ως έναν από τους τοίχους τους. Κοντά στο βόρειο τμήμα του τείχους υπάρχουν τα ίχνη μιας μικρής πηγής, γι’ αυτό και οι αρχαιολόγοι υπέθεσαν πως εκεί βρίσκονταν τα πρωιμότερα σπίτια της ακρόπολης.