H Μάλθη θεωρείται ο παλαιότερος ορεινός οικισμός της περιοχής που εμφανίζεται από την εποχή των πρώτων ελληνικών φύλων. Ανασκαφές που ξεκίνησαν το 1912 αποκάλυψαν τον αρχαιολογικό χώρο της Μάλθης, αλλά και τον καλύτερα διατηρημένο θολωτό τάφο της Μεσσηνίας που διατηρεί ακέραιη τη θόλο του.
Στα νεότερα χρόνια η Μάλθη είναι συνδεδεμένη με την Eλληνική Eπανάσταση του 1821, καθώς στην περιοχή της αρχαίας Μάλθης, στο όρος Ραμοβούνι, γεννήθηκε ο Θεόδωρος Κολοκοτρώνης στις 3 Απριλίου 1770. Στο σημείο που εικάζεται ότι γεννήθηκε, κάτω από ένα δέντρο, έχει στηθεί ανδριάντας στον οποίο απεικονίζεται έφιππος ο Γέρος του Μοριά.
Στη διάρκεια της Τουρκοκρατίας και μέχρι το 1927 το χωριό ονομαζόταν Μποντιάς. Οι κάτοικοί του, ακόμα και σήμερα ζουν από την καλλιέργεια της ελιάς και παράγουν εξαιρετικής ποιότητας ελαιόλαδο. Τέλος, αξίζει να σημειωθεί πως τα τελευταία χρόνια επιστρέφουν στην περιοχή ντόπιοι κάτοικοι, που στο παρελθόν είχαν μετακομίσει σε πόλεις, ανακαινίζοντας τα πατρικά τους για να τα χρησιμοποιήσουν κυρίως ως εξοχική κατοικία.